Struktur perekonomian Desa Antapan masih bercorak agraris yang menitik beratkan pada sektor pertanian. Hal ini didukung oleh penggunaan lahan pertanian masih mempunyai porsi yang terbesar sebanyak 75% dari total penggunaan lahan desa,juga 25% mata pencaharian penduduk menggantungkan hidup pada sektor non pertanian. Pada sektor ini komoditi yang menonjol sebagai hasil andalan adalah Hortikultura dan Sebagian kecil tanaman padi yang khusus untuk konsumsi sendiri.
Beberapa sektor ekonomi yang tergolong economic base dan menonjol di samping sektor pertanian adalah perdagangan terutama penjualan hasil pertanian di sector hortikultura. Pada sektor perdagangan hasil bumi sedangkan fasilitas pasar belum ada di Desa Antapan.Pada sektor industri rumah tangga dan pengolahan termasuk di dalamnya adalah kerajinan ukir, jahit, dan tukang kayu.
Pada sektor jasa yang menonjol adalah lembaga/istitusi keuangan mikro berupa Koperasi, LPD sebagai pendukung ekonomi desa. Hal ini tumbuhnya diharapkan akan membawa dampak positif dalam perkembangan ekonomi desa secara keseluruhan.